澎湖县工商联
开展澎湖县工商专业培训，帮助会员改进经营管理，完善财会管理，提高生产技术和产品质量。
引导澎湖县会员积极参加国家经济建设，推动社会主义市场经济体制逐步完善，促进社会全面进步。
为澎湖县会员提供信息和科技、管理、法律、会计、审计、融资、咨询等服务。
下属机构
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宣传教育部
宣传澎湖县工商联工作。负责澎湖县非公有制经济人士思想政治工作。
宣传澎湖县非公有制经济发展成就和非公有制经济人士中的先进典型和事迹，引导非公有制经济人士走中国特色社会主义道路。
负责澎湖县机关重要会议、活动的照片、音像资料等电子档案的收集、整理、保存。
宣传党和国家的方针、政策，引导澎湖县非公有制经济人士贯彻落实科学发展观。
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参政议政调研部
负责制定澎湖县调研计划并组织实施。开展政策理论研究。
负责对澎湖县政策法规、重要文件等征求意见稿提出修改建议。
负责澎湖县集体提案、建议、大会发言，负责反映社情民意信息工作。
负责起草澎湖县工商联主要领导重要讲话。
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办公室
负责澎湖县机要、档案、保密、财务、固定资产管理、节能减排、信访、接待、后勤服务、文印、值班、安全保卫和双拥工作。
负责澎湖县综合文件的起草。负责信息工作。负责领导秘书工作。
负责澎湖县机关内外联系和协调工作。组织、服务、保障好重大会务活动、重要会议。
负责澎湖县机关基建工作。
