凭祥市台办
管理协调两岸通邮、通航、通商事务；负责凭祥市对台宣传、教育工作和有关台湾工作的新闻发布；处理涉台的重大事件。
研究台湾形势和两岸关系发展动向；协调凭祥市有关部门研究、草拟涉台的法律、法规，统筹协调涉台法律事务。
会同凭祥市有关部门统筹协调和指导对台经贸工作和两岸金融、文化、学术、体育、科技、卫生等各个领域的交流与合作，以及两岸人员往来、考察、研讨等工作，国际会议的涉台工作。
下属机构
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秘书局
承办凭祥市台办文电、秘书、会议、通信、信息工作。
负责凭祥市赴台审批办理工作，联系各地各部门涉台机构。
负责凭祥市台办档案、报刊、图书资料工作。编辑刊物。
负责协调凭祥市台办机关日常工作。
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经济局
研究协调凭祥市对台商投资和赴台投资的政策。
指导、管理凭祥市台资企业协会，负责对台资企业的政策指导及服务工作。
会同凭祥市有关部门研究、草拟对台经济、贸易、金融、科技等方面的法律、法规、政策，并负责协调和检查落实。
负责管理和协调两岸“三通”事务。统筹协调和指导凭祥市对台经济工作。
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投诉协调局
指导检查凭祥市各地台办的台胞投诉案件的处理。
承担凭祥市台商权益保障工作联席会议办公室工作职责。
组织凭祥市各地台办投诉协调工作经验和信息交流，通报台湾同胞投诉案件处理情况。
负责协调处理凭祥市重大、复杂的台湾同胞投诉案件。
