金门县财政局
会同有关部门管理金门县财政社会保障和就业及医疗卫生支出，贯彻执行社会保障资金的财务管理制度，编制金门县社会保障预决算草案，组织实施对社会保障资金使用的财政监督。
负责承办和监督金门县财政的经济发展支出、政府性投资项目的财政拨款，参与拟订建设投资的有关政策，制定基本建设财务制度，负责有关政策性补贴和专项储备资金财政管理工作；负责农业综合开发管理工作；承担财政投资评审管理工作。
依法负责金门县国有资本经营预算相关工作，收取市本级企业国有资本收益，制定并组织实施企业财务制度，参与拟订企业国有资产管理相关制度，按规定负责资产评估的有关管理工作。
下属机构
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国库科
承担拟订金门县国库管理制度、财政总预算会计核算制度。
研究和推行金门县国库集中收付制度，指导下级财政总预算会计工作。
承担金门县国债兑付及相关管理工作。
统一管理金门县财政及本级预算单位的银行账户开立、变更和备案。
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预算科
执行国家财政预算的方针、政策，提出金门县财政发展战略和政策。
指导、监督金门县财政收支平衡工作。
贯彻执行省财政的转移支付制度，指导金门县乡镇财政管理体制改革工作。
承担金门县财政与省财政结算、对市（区）财政总决算的批复工作。
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综合科
拟订金门县非税收入管理政策，承担本级非税收入管理工作。
组织金门县行政事业性收费、政府性基金、国有资源有偿使用收入、彩票公益金、罚没收入、以政府名义接受的捐赠收入，以及其他政府非税收入的征收和监管。
贯彻执行国家有关政府非税收入管理的方针、政策和法律、法规，并结合金门县实际，研究制定和完善地方性政府非税收入管理的规章制度。
参与监管金门县住房保障和住房公积金。
