额济纳旗疾病预防控制中心
承担额济纳旗县（市）疾病预防控制机构业务指导和考核、人员培训工作。开展疾病预防控制应用性科学研究，推广先进技术。
承担额济纳旗重大突发公共卫生事件调查与处置工作任务。
协助额济纳旗市级卫生行政部门和有关部门对重大食品安全、环境卫生和生活饮用水安全事故开展流行病学调查，并提出处理建议。
下属机构
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性病艾滋病防治科
负责额济纳旗辖区内人员的自愿咨询检测工作。
负责对额济纳旗高危场所的高危人群的干预工作。
负责额济纳旗性病、艾滋病的疫情分析及预测预报，疫情管理。
实施额济纳旗性病、艾滋病的预防控制规划和措施，开展性病艾滋病监测与预防控制工作。
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地方病防制与消杀科
负责额济纳旗消毒杀虫工作的监测、培训、考核和技术指导工作。
开展对额济纳旗地方病和寄生虫病的诊疗服务。研究消杀工作常规、措施和技术标准。
开展额济纳旗预防控制和监测工作，负责碘缺乏病的监测，开展碘缺乏病预防控制工作。
实施额济纳旗地方病、寄生虫病的预防控制规划。
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免疫规划科
负责额济纳旗冷链管理，计免资料管理和预防用生物制品的供应、贮存和管理工作。
负责组织实施额济纳旗预防接种及其管理，预防接种异常反应应诊断与处理、业务指导，开展病原学、血清学、免疫学监测工作，开展免疫针对传染病的预防控制和疫情监测。
实施额济纳旗免疫规划相关传染病的预防控制与相关管理措施的落实。
负责额济纳旗计划免疫相关资料的收集、统计和分析、报告工作。
