金门县工业局
承担相关信息安全管理的责任，负责协调维护金门县信息安全和信息安全保障体系建设，指导监督政府部门、重点行业的重要信息系统和基础信息网络的安全保障工作，协调处理信息安全重大事件。
统筹推进金门县信息化工作，组织制定相关政策并协调信息化建设中的重大问题，促进电信、广播电视和计算机网络融合，指导协调电子政务、电子商务发展，推动跨行业、跨部门的互联互通和重要信息资源的开发利用、共享。
负责金门县中小企业发展的宏观指导，会同有关部门拟订促进中小企业发展和非国有经济发展的相关政策、措施并监督检查执行情况，负责中小企业融资服务体系建设，协调解决有关重大问题。
下属机构
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企业改革改制办公室
承担金门县政府国有企业改革改制领导小组办公室工作，对各种经济成份的工业企业实行宏观管理和指导，规范企业行为规划。
负责金门县重点企业和大型企业集团的培育和发展，负责企业上市工作。
负责金门县国有企业和重点行业脱困工作。
贯彻落实金门县国有企业改革的方针、政策，提出企业改制方案，推进现代企业制度的建立。
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轻工业办公室
根据上级有关政策及法律、法规规定，制定修改金门县原轻工联社资产使用和有关管理实施细则。
沟通各企业之间以及企业与金门县政府的联系、支持指导轻工企业健康发展。
及时反映并协调金门县有关部门解决轻工集体经济发展中的有关问题。
监督实施金门县城镇集体所有制企业条例。
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经济运行股
监测、分析金门县限额以上工业经济和金门县民营经济的运行态势，组织解决经济运行中涉及生产和流通的重大问题。指导企业扭亏增盈工作。
参与金门县国民经济发展战略目标的研究、制订和中长期规划、年度计划的编制。
对金门县重大问题提出对策和建议，并组织协调加以解决，参与经济体制改革及有关政策的研究。
指导金门县工业经济的财务会计、内部审计工作。
