昭通卫生局
负责制定昭通当地中医药工作发展规划，促进中医药事业和中西医结合工作的协调发展。
依法管理昭通医疗机构内部临床药事工作。协助价格主管部门制订医疗卫生服务价格，负责监管各级各类医疗卫生机构的医疗服务价格执行情况。
负责制订或审定（审核、批准）昭通各级各类医疗卫生机构的医疗、护理、医技及相关服务的质量标准、技术规范、职业道德规范，并实施监督和管理。
下属机构
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疾病控制处
拟订昭通健康促进工作规划和计划并组织实施。
拟订昭通公共卫生问题的干预措施并组织实施。
组织对昭通重大传染病、地方病的综合防治、监测和疫情报告，对重大突发疫情实施紧急处置。
组织指导昭通免疫规划的实施和疫苗接种异常反应事件的调查处置。
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法制监督处
组织开展整顿和规范昭通医疗服务市场工作，组织打击非法行医，督查督办重大违法案件。
组织开展昭通消费环节食品安全监督管理和卫生执法监督工作。
承担昭通卫生局行政规范性文件的合法性审核和有关备案工作。
承担昭通卫生局行政复议和应诉的有关工作。
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卫生应急办公室
承担昭通突发公共卫生事件应急指挥部办公室工作。
组织协调昭通重大活动的卫生应急保障工作。
组织协调昭通重大自然灾害、恐怖事件、中毒事件及核辐射事故等的紧急医疗救援工作。
建立、完善昭通卫生应急信息系统。
