承担推进浙江创新体系建设的责任。会同有关部门编制浙江创新体系建设规划，拟订促进浙江知识创新、技术创新的政策措施，制定科研条件保障规划和提出相关政策，推进科技基础条件平台、实验室体系和重点科研基地、产业创新平台、重大创新基地建设和科技资源共享，拟订科技促进企业自主创新的政策措施，会同有关部门认定创新型企业和自主创新产品，推动企业自主创新能力建设。
会同浙江有关部门提出科技体制改革的政策和措施建议、推进科技体制改革工作，审核相关科研机构的组建和调整，培育发展民办科研机构，优化科研机构布局。
拟订浙江科技合作与交流的政策措施，组织实施政府间及有关国际组织间的科技合作项目，承办涉港澳台地区的科技合作与交流事宜。
贯彻执行国家和浙江有关科学技术工作的方针政策和法律法规，起草有关地方性法规、规章草案和政策措施，并组织实施和监督检查。