负责合川区环境问题的统筹协调和监督管理。牵头调查处理环境污染事故和生态破坏事件；指导协调镇乡（街道）突发环境事件的应急、预警工作；协调解决有关跨区域环境污染纠纷；组织和协调合川区重点流域、区域污染防治工作。
指导、协调、监督合川区生态保护工作。拟定生态保护规划，组织评估生态环境质量状况；监督对生态环境有影响的自然资源开发利用活动、重要生态环境建设和生态破坏恢复工作；指导、协调和监督各种类型的自然保护区、风景名胜区、森林公园、地质公园的环境保护工作；协调和监督野生动植物保护、湿地环境保护、矿山复垦、石漠化防治工作；协调指导农村生态环境保护；监督生物技术环境安全，牵头生物物种（含遗传资源）保护工作，组织协调生物多样性保护工作。
承办合川区人民政府和市环境保护局交办的其他事项。
承担落实合川区政府减排目标的责任；组织拟定合川区污染物排放总量控制计划并监督实施，督查、督办、核查合川区污染物减排任务完成情况，实施环境保护目标责任制、总量减排考核并公布考核结果。