昌吉州水文水资源勘测局
承担昌吉州江河湖库及地下水水量和水质的监测与分析，昌吉州水资源调查、分析与评价，水环境监测与评价。
参与编制昌吉州水资源公报，负责编制地下水季报和年报、水质简报和水功能区通报。
受厅委托进行昌吉州水资源综合规划和有关专业规划编制、水功能区划分、江河湖库纳污能力审定、提出限制昌吉州排污总量的意见等具体业务技术工作。
下属机构
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水情科
承办昌吉州水文水资源勘测局领导交办的其他工作。
指导昌吉州水情工作。
负责昌吉州报汛站网的规划与管理，审核下达年度报汛计划。
负责昌吉州水情信息管理，编制和发布水情简报、月报、年报，开展专题水情分析及服务。
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水质科
承担昌吉州有关水资源保护、水环境改善方面的规划和研究。
承办昌吉州水文水资源勘测局领导交办的其他工作。
负责昌吉州水质监测站网的规划与管理，审批下达年度水质监测站网计划并组织实施。
负责昌吉州水质监测资料的整汇编。
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水资源评价科
负责昌吉州水文水资源调查评价资质的资格审批与管理工作。
归口管理昌吉州水资源调查评价、水文分析与计算、水资源论证等工作。
组织开展江苏省水资源公报编制工作。
负责昌吉州水文科技研究工作。
