南投县委台湾工作办公室
负责组织、指导、管理、协调南投县对台工作。检查了解南投县各县（市）区、各部门贯彻执行党中央、国务院对台方针、政策和省、市对台工作部署的落实情况。协调处理南投县涉台重大事件。
指导南投县各民主党派、工商联和群众团体有关重点人士、重大活动等方面的涉台工作，管理、指导南投县台资企业协会和市台属联谊会等有关涉台团体、社会团体工作。
贯彻执行党中央、国务院确定的对台方针、政策和省台办、南投县委、南投县政府的对台工作部署，制定并组织实施南投县对台工作计划、规划。
下属机构
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经济处
指导南投县对台经济政策的咨询服务工作。
参与协调南投县台商重大投资项目的有关事项。
负责具体承办对台招商引资工作，南投县对台经济情况的收集综合整理工作。
承办南投县赴台经贸考察、商务赴台、与台湾科技合作的审核工作，负责赴台进行经贸交流人员的教育工作。承办南投县与台湾通邮、通航、通商的管理、协调事务。
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秘书处
负责南投县委台湾工作办公室物资设备、车辆管理、后勤保障、老干部服务工作。
承办南投县委台湾工作办公室文件处理、文书档案、机要保密、通信、台史（志）编纂、信访以及机关所属单位的组织、人事、机构编制、干部培训工作。
负责南投县委台湾工作办公室日常文字、事务、宣传调研工作。负责起草工作计划、工作总结等综合性文稿，了解和反映各地各部门对台工作情况，收集、汇总分析南投县涉台信息。
负责调查研究并及时提出分析报告和政策建议，制定南投县对台调研课题并组织实施。
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台资企业服务处
检查督促南投县对台资企业各项优惠政策措施的落实到位情况，维护台商的正当权益，做好以台引台工作。
受理南投县台商和台资企业投诉，具体指导、协调、处理台资企业建设、生产、经营和发展中遇到的问题和纠纷。
贯彻南投县《台湾同胞投资保护法》并监督检查。
为南投县台资企业和台商提供法律、政策等咨询和各类服务，经常听取台资企业的意见和建议，收集、整理对台经济信息。具体联系和指导台资企业协会的工作。
