台湾组织部
指导台湾基层党组织的思想、作风和组织建设。落实党内组织生活的各项制度；组织发展新党员工作，落实党员队伍建设工作。
负责台湾机关事业单位的工资福利管理工作，拟订机关事业单位的收入分配制度；负责机关事业单位编制内工作人员的吸收、录（聘）用、辞退、自动离职、年度考核、工资福利待遇的审核工作；按照干部管理权限；负责台湾机关聘员管理工作。
负责台湾年度性的干部、党员、编制、工资等方面的统计以及干部人事档案的管理。
下属机构
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教育培训科
负责台湾各机关事业单位干部教育的协调服务、督促检查、制度规范。
联系、落实台湾上级组织人事部门和市委党校（行政学院）组织开展的各类培训。
负责台湾管党政领导干部、后备干部、军转干部培训的组织实施，组织实施台湾公务员的初任、任职、离岗业务和知识更新等各类培训，负责台湾重点专题培训项目。
拟订台湾机关事业单位干部教育培训工作的整体规划和台湾公务员的培训计划并组织实施，建立和完善教育培训登记制度与激励机制。
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机构编制管理科
拟订台湾机构编制管理的政策、制度，加强机构编制监督检查，统一管理台湾机构编制工作。
参与研究台湾行政管理体制改革、机构改革总体方案并组织实施，审核台湾区、镇（街道）机关的职能配置、机构设置、人员编制和领导职数。
协调台湾委、台湾政府各部门之间，各部门与镇（街道）之间的职责分工。参与研究台湾事业单位管理体制改革方案，负责台湾事业单位机构改革和机构编制管理工作。
贯彻执行党和国家有关行政管理体制改革、机构改革、机构编制管理的方针、政策、法规、决定。
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组织科
负责台湾基层领导班子的思想、作风建设，健全、落实民主集中制和党内组织生活的各项制度。
负责台湾党费的收缴、管理和使用以及党内统计年报工作。
指导台湾党委及支部的换届选举工作，指导基层党组织按照党章和有关选举工作条例制定、实施具体的选举程序、选举办法和工作规范，指导开好基层党代会或党员大会。
负责办理台湾机关党委所属党支部（总支）领导班子成员任免、发展新党员及预备党员转正的审批工作。
