吐鲁番市农业局
协调吐鲁番市农业各产业和农村经济发展；指导农村二、三产业发展，扶持发展农产品加工流通业、乡村旅游等服务业。
承担吐鲁番市农产品质量安全监督管理责任。开展农产品安全风险评估，组织农产品质量安全监测，发布有关农产品质量安全信息；拟订有关农产品质量安全的地方标准，并会同有关部门组织实施；指导农业检验检测体系建设；依法实施符合安全标准的农产品产地认定和产品认证；组织农产品质量安全的监督管理。
组织和指导吐鲁番市社会主义新农村建设。提出农村社会事业发展政策建议，并协调相关事项；组织开展吐鲁番市新农村建设试点工作；参与农村社会发展、基层组织建设、精神文明建设和民主法制建设相关工作。
下属机构
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财务股
负责吐鲁番市农业局机关和所属事业单位农业财政预算资金、专项资金、项目资金的管理和安全。
指导和监督吐鲁番市农业局所属事业单位对国有资产的使用，农用物资实行政府采购管理。
负责编报吐鲁番市农业局本部门预算、决算并组织实施。
负责吐鲁番市农业局机关及所属单位的财务会计制度建设、资金（资产）管理与监督以及绩效评价工作。
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农产品质量安全监督管理股
负责吐鲁番市农产品质量安全监测。
承担吐鲁番市农业检验检测体系建设和机构考核工作。
依法实施符合安全标准的吐鲁番市农产品产地认定、产品认证和农产品质量安全监督管理。
承担吐鲁番市农业转基因生物生产加工的安全监督管理工作。
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政策法规与农情信息股
负责吐鲁番市农业局本部门所有行政许可事项和非行政许可审批事项的受理、审查、决定，并依法进行监督。
负责组织调查研究并提出吐鲁番市农业农村发展、保护意见和建议。拟订农业生产发展战略、中长期规划和年度计划并组织实施。
指导吐鲁番市生产优化布局和标准化、规模化生产及产品品质改善工作。
拟订吐鲁番市农业和农村经济信息体系建设和农产品市场流通体系建设规划并组织实施。
